兩研究小組公佈“人類蛋白質組地圖”
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有兩個獨立的研究小組最近各自公佈了接近完成的“人類蛋白質組草圖”,其中之一是由印度和美國的研究人員組成的聯合研究,另一項研究則是由德國的科學家完成。
兩個研究小組都使用先進的設備對人體組織上的蛋白質進行了收集,並製作了一份詳盡的人類蛋白質組地圖--也就是人類基因組的蛋白質當量。第一項研究由印度生物信息研究所和美國約翰霍普金斯大學等機構的科學家共同完成,他們描繪了由17924個(大約相當於已註釋基因總數的84%)基因編碼的蛋白質所組成的地圖。另一個德國的研究小組則是將人體內現有的19629種蛋白質中的92%進行了編目分類。
除此之外,兩個研究小組都發現了一些由先前被認爲是“無用”基因或是不具備功能的DNA編碼的蛋白質,研究發現雖然科學家們已經對人類的基因信息進行了長期的整理歸納,但依然還有幾個基因的功能是不能確定的。印度的研究小組找到了至少200個以前未被發現的人類蛋白質,並將他們稱爲“失落的蛋白質”。
這次組建的新數據庫與在2003年完成的人類基因組計劃類似,這份“蛋白質地圖”目前雖然還不完整,但足以填補在蛋白質研究領域中的空白,研究人員對這個蛋白質數據庫的誕生感到十分的激動。
據來自班加羅爾生物信息學研究所的Harsha Gowda博士介紹,這次兩個研究小組在互相不知道對方工作內容的情況下不約而同的繪製出了這份草圖,實在是一個讓人驚奇的巧合。他認爲今後將兩個數據庫進行對比完善會是一件有趣的事,也能夠幫助我們擴展對人類蛋白質組的瞭解。
另一方面,德國方面研究的首席作者,慕尼黑理工大學的Bernhard Kuster教授表示,Pandey 的研究論文是一個很了不起的成果,雙方的研究都大幅度的提升了我們對人類蛋白質組合基因組的瞭解。這個Pandey指的正是約翰霍普金斯大學的Akhilesh Pandey,他與印度班加羅爾的研究人員一起致力於蛋白質組地圖的研究。
兩個研究小組使用了略有不同的方式來繪製人類蛋白質組地圖,印度的研究人員表示他們通過從30個人體組織樣本身上移除蛋白質的方式“白手起家”,然後使用質譜分析法找到了這些蛋白質的元素丰度,研究小組在這個過程中只使用了普通蛋白質,所有的研究數據都從一個單獨的平臺獲得。
據Akhilesh Pandey介紹,他們的實驗室獲得的數據將成爲業界的“黃金標準”,因爲這些數據是通過統一的方法和分析產生的。
而德國的研究小組則從公共數據庫收集數據,並將這些數據與實驗室生成的數據進行合併。
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